Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms