Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Gm3415J3QMS8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms