Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm11236J3QMS7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Gm11236J3QMS7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gm11236J3QMS7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gm11236J3QMS7 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gm11236J3QMS7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gm11236J3QMS7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm11236J3QMS7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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