Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930544D05RikJ3QK56 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms