Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21060J3KMU4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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