Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf4bG5E8Z2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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