Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms