Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms