Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms