Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8247F6VRJ8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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