Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6F6VAN0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms