Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pagr1bF6V0H0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms