Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms