Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod3E9QA62 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms