Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd35E9Q9D8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms