Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
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ApobE9Q414 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
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ApobE9Q414 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
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