Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Susd1E9Q3H4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Susd1E9Q3H4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Susd1E9Q3H4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Susd1E9Q3H4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Susd1E9Q3H4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Susd1E9Q3H4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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