Protein–RNA interactions for Protein: E9PUT9

Gm3252, Predicted gene 3252, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3252E9PUT9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms