Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms