Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms