Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim30cD3YVI9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30cD3YVI9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30cD3YVI9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30cD3YVI9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30cD3YVI9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30cD3YVI9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30cD3YVI9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30cD3YVI9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30cD3YVI9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30cD3YVI9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30cD3YVI9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30cD3YVI9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms