Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clip3B9EHT4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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