Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms