Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms