Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Prrt4B2RU40 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Prrt4B2RU40 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Prrt4B2RU40 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Prrt4B2RU40 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt4B2RU40 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms