Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc22a28B2RT89 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc22a28B2RT89 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc22a28B2RT89 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc22a28B2RT89 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc22a28B2RT89 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc22a28B2RT89 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc22a28B2RT89 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc22a28B2RT89 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc22a28B2RT89 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc22a28B2RT89 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc22a28B2RT89 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc22a28B2RT89 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms