Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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PtprsB0V2N1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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PtprsB0V2N1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PtprsB0V2N1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PtprsB0V2N1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PtprsB0V2N1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PtprsB0V2N1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PtprsB0V2N1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PtprsB0V2N1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PtprsB0V2N1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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PtprsB0V2N1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms