Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms