Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms