Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calcoco2A2A6M5 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calcoco2A2A6M5 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calcoco2A2A6M5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calcoco2A2A6M5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calcoco2A2A6M5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calcoco2A2A6M5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calcoco2A2A6M5 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calcoco2A2A6M5 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calcoco2A2A6M5 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calcoco2A2A6M5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calcoco2A2A6M5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calcoco2A2A6M5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calcoco2A2A6M5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calcoco2A2A6M5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms