Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Hdac6Q9Z2V5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hdac6Q9Z2V5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hdac6Q9Z2V5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hdac6Q9Z2V5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hdac6Q9Z2V5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hdac6Q9Z2V5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hdac6Q9Z2V5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hdac6Q9Z2V5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hdac6Q9Z2V5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hdac6Q9Z2V5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hdac6Q9Z2V5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hdac6Q9Z2V5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hdac6Q9Z2V5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hdac6Q9Z2V5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hdac6Q9Z2V5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hdac6Q9Z2V5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hdac6Q9Z2V5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hdac6Q9Z2V5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hdac6Q9Z2V5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hdac6Q9Z2V5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hdac6Q9Z2V5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hdac6Q9Z2V5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hdac6Q9Z2V5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hdac6Q9Z2V5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hdac6Q9Z2V5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hdac6Q9Z2V5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hdac6Q9Z2V5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hdac6Q9Z2V5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hdac6Q9Z2V5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hdac6Q9Z2V5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hdac6Q9Z2V5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hdac6Q9Z2V5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hdac6Q9Z2V5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hdac6Q9Z2V5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hdac6Q9Z2V5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hdac6Q9Z2V5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hdac6Q9Z2V5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hdac6Q9Z2V5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hdac6Q9Z2V5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hdac6Q9Z2V5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hdac6Q9Z2V5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hdac6Q9Z2V5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hdac6Q9Z2V5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hdac6Q9Z2V5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hdac6Q9Z2V5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hdac6Q9Z2V5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hdac6Q9Z2V5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hdac6Q9Z2V5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Hdac6Q9Z2V5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Hdac6Q9Z2V5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hdac6Q9Z2V5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Hdac6Q9Z2V5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hdac6Q9Z2V5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hdac6Q9Z2V5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hdac6Q9Z2V5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hdac6Q9Z2V5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hdac6Q9Z2V5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Hdac6Q9Z2V5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hdac6Q9Z2V5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hdac6Q9Z2V5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hdac6Q9Z2V5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hdac6Q9Z2V5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Hdac6Q9Z2V5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hdac6Q9Z2V5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hdac6Q9Z2V5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hdac6Q9Z2V5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Hdac6Q9Z2V5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hdac6Q9Z2V5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hdac6Q9Z2V5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Hdac6Q9Z2V5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Hdac6Q9Z2V5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hdac6Q9Z2V5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hdac6Q9Z2V5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hdac6Q9Z2V5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Hdac6Q9Z2V5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hdac6Q9Z2V5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hdac6Q9Z2V5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hdac6Q9Z2V5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Hdac6Q9Z2V5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hdac6Q9Z2V5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Hdac6Q9Z2V5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Hdac6Q9Z2V5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hdac6Q9Z2V5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hdac6Q9Z2V5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms