Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt16Q9Z2K1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt16Q9Z2K1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt16Q9Z2K1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt16Q9Z2K1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt16Q9Z2K1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt16Q9Z2K1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt16Q9Z2K1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt16Q9Z2K1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt16Q9Z2K1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt16Q9Z2K1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt16Q9Z2K1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt16Q9Z2K1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt16Q9Z2K1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt16Q9Z2K1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt16Q9Z2K1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt16Q9Z2K1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt16Q9Z2K1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt16Q9Z2K1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt16Q9Z2K1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt16Q9Z2K1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt16Q9Z2K1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt16Q9Z2K1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt16Q9Z2K1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt16Q9Z2K1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt16Q9Z2K1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt16Q9Z2K1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt16Q9Z2K1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt16Q9Z2K1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt16Q9Z2K1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt16Q9Z2K1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt16Q9Z2K1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms