Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Mbd4Q9Z2D7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd4Q9Z2D7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms