Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn6Q9Z262 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn6Q9Z262 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn6Q9Z262 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Cldn6Q9Z262 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn6Q9Z262 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms