Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cldn8Q9Z260 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cldn8Q9Z260 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn8Q9Z260 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn8Q9Z260 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms