Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sfrp4Q9Z1N6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp4Q9Z1N6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms