Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngr4Q9Z1L2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngr4Q9Z1L2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngr4Q9Z1L2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngr4Q9Z1L2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngr4Q9Z1L2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngr4Q9Z1L2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngr4Q9Z1L2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Syngr4Q9Z1L2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syngr4Q9Z1L2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngr4Q9Z1L2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms