Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I6

Slfn2, Schlafen 2, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn2Q9Z0I6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slfn2Q9Z0I6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slfn2Q9Z0I6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slfn2Q9Z0I6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slfn2Q9Z0I6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slfn2Q9Z0I6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slfn2Q9Z0I6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slfn2Q9Z0I6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slfn2Q9Z0I6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slfn2Q9Z0I6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slfn2Q9Z0I6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slfn2Q9Z0I6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slfn2Q9Z0I6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slfn2Q9Z0I6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slfn2Q9Z0I6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn2Q9Z0I6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn2Q9Z0I6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn2Q9Z0I6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn2Q9Z0I6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn2Q9Z0I6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slfn2Q9Z0I6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slfn2Q9Z0I6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slfn2Q9Z0I6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slfn2Q9Z0I6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slfn2Q9Z0I6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slfn2Q9Z0I6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slfn2Q9Z0I6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slfn2Q9Z0I6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slfn2Q9Z0I6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn2Q9Z0I6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn2Q9Z0I6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn2Q9Z0I6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn2Q9Z0I6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn2Q9Z0I6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn2Q9Z0I6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn2Q9Z0I6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn2Q9Z0I6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn2Q9Z0I6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn2Q9Z0I6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn2Q9Z0I6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn2Q9Z0I6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn2Q9Z0I6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn2Q9Z0I6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn2Q9Z0I6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn2Q9Z0I6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms