Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clip2Q9Z0H8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clip2Q9Z0H8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Clip2Q9Z0H8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms