Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pmfbp1Q9WVQ0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pmfbp1Q9WVQ0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pmfbp1Q9WVQ0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pmfbp1Q9WVQ0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pmfbp1Q9WVQ0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pmfbp1Q9WVQ0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pmfbp1Q9WVQ0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pmfbp1Q9WVQ0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pmfbp1Q9WVQ0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pmfbp1Q9WVQ0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Pmfbp1Q9WVQ0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pmfbp1Q9WVQ0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Pmfbp1Q9WVQ0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pmfbp1Q9WVQ0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms