Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ5

Tnni1, Troponin I, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni1Q9WUZ5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Tnni1Q9WUZ5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnni1Q9WUZ5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnni1Q9WUZ5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnni1Q9WUZ5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms