Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH5

Trim10, Tripartite motif-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim10Q9WUH5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim10Q9WUH5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim10Q9WUH5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim10Q9WUH5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim10Q9WUH5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim10Q9WUH5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim10Q9WUH5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim10Q9WUH5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim10Q9WUH5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim10Q9WUH5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim10Q9WUH5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim10Q9WUH5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim10Q9WUH5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim10Q9WUH5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim10Q9WUH5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim10Q9WUH5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim10Q9WUH5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim10Q9WUH5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim10Q9WUH5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim10Q9WUH5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim10Q9WUH5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim10Q9WUH5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim10Q9WUH5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim10Q9WUH5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim10Q9WUH5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim10Q9WUH5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim10Q9WUH5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim10Q9WUH5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim10Q9WUH5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim10Q9WUH5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim10Q9WUH5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim10Q9WUH5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms