Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nrf1Q9WU00 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nrf1Q9WU00 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nrf1Q9WU00 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nrf1Q9WU00 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nrf1Q9WU00 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nrf1Q9WU00 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nrf1Q9WU00 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nrf1Q9WU00 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nrf1Q9WU00 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nrf1Q9WU00 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nrf1Q9WU00 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nrf1Q9WU00 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nrf1Q9WU00 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nrf1Q9WU00 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nrf1Q9WU00 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nrf1Q9WU00 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nrf1Q9WU00 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Nrf1Q9WU00 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nrf1Q9WU00 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nrf1Q9WU00 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nrf1Q9WU00 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nrf1Q9WU00 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nrf1Q9WU00 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nrf1Q9WU00 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nrf1Q9WU00 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nrf1Q9WU00 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nrf1Q9WU00 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nrf1Q9WU00 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nrf1Q9WU00 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nrf1Q9WU00 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Nrf1Q9WU00 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nrf1Q9WU00 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nrf1Q9WU00 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nrf1Q9WU00 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nrf1Q9WU00 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nrf1Q9WU00 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nrf1Q9WU00 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nrf1Q9WU00 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nrf1Q9WU00 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nrf1Q9WU00 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nrf1Q9WU00 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nrf1Q9WU00 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nrf1Q9WU00 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nrf1Q9WU00 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nrf1Q9WU00 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nrf1Q9WU00 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nrf1Q9WU00 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nrf1Q9WU00 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nrf1Q9WU00 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nrf1Q9WU00 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nrf1Q9WU00 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms