Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp18Q9WTV6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp18Q9WTV6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp18Q9WTV6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp18Q9WTV6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp18Q9WTV6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp18Q9WTV6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp18Q9WTV6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp18Q9WTV6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp18Q9WTV6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp18Q9WTV6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp18Q9WTV6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp18Q9WTV6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp18Q9WTV6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp18Q9WTV6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp18Q9WTV6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp18Q9WTV6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp18Q9WTV6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp18Q9WTV6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp18Q9WTV6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp18Q9WTV6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp18Q9WTV6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp18Q9WTV6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp18Q9WTV6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp18Q9WTV6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp18Q9WTV6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp18Q9WTV6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp18Q9WTV6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp18Q9WTV6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp18Q9WTV6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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