Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn8aQ9WTU3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scn8aQ9WTU3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn8aQ9WTU3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn8aQ9WTU3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn8aQ9WTU3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn8aQ9WTU3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn8aQ9WTU3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn8aQ9WTU3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn8aQ9WTU3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn8aQ9WTU3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn8aQ9WTU3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn8aQ9WTU3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn8aQ9WTU3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn8aQ9WTU3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn8aQ9WTU3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn8aQ9WTU3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn8aQ9WTU3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn8aQ9WTU3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn8aQ9WTU3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn8aQ9WTU3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn8aQ9WTU3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn8aQ9WTU3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn8aQ9WTU3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn8aQ9WTU3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn8aQ9WTU3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn8aQ9WTU3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn8aQ9WTU3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn8aQ9WTU3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms