Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpv2Q9WTR1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trpv2Q9WTR1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpv2Q9WTR1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.1 ms