Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PplQ9R269 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
PplQ9R269 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PplQ9R269 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PplQ9R269 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PplQ9R269 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PplQ9R269 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PplQ9R269 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PplQ9R269 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PplQ9R269 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PplQ9R269 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
PplQ9R269 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PplQ9R269 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PplQ9R269 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PplQ9R269 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PplQ9R269 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PplQ9R269 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PplQ9R269 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PplQ9R269 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PplQ9R269 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PplQ9R269 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PplQ9R269 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PplQ9R269 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
PplQ9R269 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC31.07■■■□□ 2.57
PplQ9R269 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
PplQ9R269 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PplQ9R269 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PplQ9R269 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PplQ9R269 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PplQ9R269 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PplQ9R269 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PplQ9R269 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PplQ9R269 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PplQ9R269 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PplQ9R269 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PplQ9R269 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PplQ9R269 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PplQ9R269 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
PplQ9R269 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PplQ9R269 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PplQ9R269 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PplQ9R269 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PplQ9R269 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PplQ9R269 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PplQ9R269 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PplQ9R269 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PplQ9R269 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
PplQ9R269 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PplQ9R269 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PplQ9R269 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
PplQ9R269 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PplQ9R269 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC31■■■□□ 2.55
PplQ9R269 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
PplQ9R269 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PplQ9R269 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PplQ9R269 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PplQ9R269 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PplQ9R269 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
PplQ9R269 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PplQ9R269 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC31■■■□□ 2.55
PplQ9R269 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PplQ9R269 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PplQ9R269 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PplQ9R269 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PplQ9R269 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
PplQ9R269 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PplQ9R269 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PplQ9R269 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PplQ9R269 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PplQ9R269 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PplQ9R269 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PplQ9R269 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PplQ9R269 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PplQ9R269 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PplQ9R269 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PplQ9R269 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PplQ9R269 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PplQ9R269 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PplQ9R269 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
PplQ9R269 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PplQ9R269 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PplQ9R269 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PplQ9R269 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PplQ9R269 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PplQ9R269 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PplQ9R269 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PplQ9R269 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PplQ9R269 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PplQ9R269 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PplQ9R269 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PplQ9R269 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PplQ9R269 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PplQ9R269 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PplQ9R269 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PplQ9R269 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PplQ9R269 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PplQ9R269 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PplQ9R269 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
PplQ9R269 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PplQ9R269 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms