Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim3Q9R1R2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim3Q9R1R2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim3Q9R1R2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim3Q9R1R2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim3Q9R1R2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim3Q9R1R2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim3Q9R1R2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim3Q9R1R2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim3Q9R1R2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim3Q9R1R2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim3Q9R1R2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim3Q9R1R2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim3Q9R1R2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim3Q9R1R2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim3Q9R1R2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim3Q9R1R2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim3Q9R1R2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim3Q9R1R2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim3Q9R1R2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim3Q9R1R2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim3Q9R1R2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim3Q9R1R2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim3Q9R1R2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim3Q9R1R2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim3Q9R1R2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim3Q9R1R2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim3Q9R1R2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim3Q9R1R2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms