Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Plod1Q9R0E2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Plod1Q9R0E2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plod1Q9R0E2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Plod1Q9R0E2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms