Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nek3Q9R0A5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nek3Q9R0A5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nek3Q9R0A5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek3Q9R0A5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek3Q9R0A5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek3Q9R0A5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek3Q9R0A5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek3Q9R0A5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Nek3Q9R0A5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nek3Q9R0A5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nek3Q9R0A5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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